Variety of the hepatitis B virus genovariants in the military ; РАЗНООБРАЗИЕ ГЕНОВАРИАНТОВ ВИРУСА ГЕПАТИТА В У ВОЕННОСЛУЖАЩИХ
Aim. To estimate the distribution of genotypes and subgenotypes of the hepatitis B virus among military personnel with chronic viral hepatitis B. Materials and methods. The work used samples of blood plasma and biopsy material obtained from 90 active or retired military personnel with chronic viral hepatitis B with various degrees of fibrosis undergoing treatment in St. Petersburg. Primary detection of HBV was carried out by isolating nucleic acids (NK) from the blood plasma using the «AmplePrime Ribo-prep» commercial kit (FBIS CRIE, Moscow). Specific primers were used for the amplification and sequencing reaction. Overlapping primer pairs were used, jointly flanking 1475 base pairs (bp) fragment, including the recommended for HBV genotyping the 1169 bp Pre-S1/Pre-S2/S. Results. Among 90 samples from patients with chronic viral hepatitis B from different regions of the Russian Federation, HBV subgenotypes are represented in the following ratios: D2 = 45.6% (n=41), D1 = 32.2% (n=29), D3 = 13.3% (n=12), A2 = 6.7% (n=6), D4 and A1 by 1.1%, respectively. The distribution of HBV subgenotypes from the North Caucasian federal district (D1 – 63.6%, D2, D3, D4, A2 – by 9.1%) was significantly different from the distribution among patients from the Central and North-Western federal districts (D1-20, 9%, D2 – 58%, D3 – 16.3%, A2 – 4.8%) (χ2=11,9 при p=0,0076, df=3). Uncharacteristic for the Russian Federation subgenotypes D4 and A1, representing single imported cases. The tendency to shift the distribution of genovariants due to imports of the corresponding HBV subgenotypes from other countries, including the Central Asian countries, is discussed. Conclusion. A systematic study of the HBV isolates phylogeny provides new information about the HBV subgenotypes distribution among certain population groups, including military personnel. ; Цель: проанализировать распределение генотипов и субгенотипов вируса гепатита В среди военнослужащих с хроническим вирусным гепатитом В. Материалы и методы. В работе были использованы образцы плазмы крови и биопсийного материала тканей печени от 90 действующих или отставных военнослужащих с хроническим вирусным гепатитом В с различной активностью фиброза, проходящих обследование в клинике инфекционных болезней военно-медицинской академии имени С.М. Кирова (Санкт-Петербург, Россия). Для выявления ВГВ выделяли нуклеиновые кислоты (НК) с использованием коммерческого набора «АмплиПрайм Рибо-преп» (ФБУН ЦНИИЭ, Москва). Для амплификации и секвенирующей реакции использовали перекрывающиеся пары специфических праймеров, совместно фланкирующие фрагмент протяженностью 1475 пар оснований (п.о.), включающий рекомендованную для генотипирования ВГВ регион Pre-S1/Pre-S2/S протяженностью 1169 п.о. Результаты. Во всех 90 образцах биологического материала выявлена ДНК ВГВ следующих генотипов: D2 – 45,6% (n=41), D1 – 32,2% (n=29), D3 – 13,3% (n=12), А2 – 6,7% (n=6), D4 и А1 по 1,1% соответственно. Распределение субгенотипов ВГВ, обнаруженных в материале пациентов из Северо-Кавказского федерального округа (D1 – 63,6%, D2, D3, D4, A2 – по 9,1%), достоверно отличалось от распределения субгенотипов изолятов, полученных от пациентов из Центрального и СевероЗападного федеральных округов (D1 – 20,9%, D2 – 58%, 3 – 16,3%, A2 – 4,8%) (χ2=11,9 при p=0,0076, df=3). Выявлены нехарактерные для РФ субгенотипы D4 и А1, представляющие собой единичные завозные случаи. Обсуждается тенденция к смещению распределения геновариантов за счет завозов ВГВ соответствующих субгенотипов из других стран, в том числе стран Средней Азии. Заключение. Систематическое изучение филогении изолятов ВГВ позволяет получить новую информацию об особенностях распространения субгенотипов ВГВ среди отдельных групп населения, в том числе военнослужащих.