Lithuania's joining of the European Union (EU) opened up the possibility to receive financial support from the EU Cohesion and Structural funds. Establishing a proper system for the management and control of EU financial support has become one of the most important tasks for the Lithuanian Government. Since non-eligible funds must be returned to the European Commission's account, the control system for EU financial support requires special attention. Since Lithuania entered the European Union, EU financial support has been included in the national budget. Since the budget of the Republic of Lithuania is subject to public financial control, EU financial support must come under public scrutiny as well. A control system for EU financial support was created during the 2004–2006 programming period. However, when defining the activities of the control subjects, insufficient powers were provided to ensure their effective work in the supervision of European Union funds.
Lithuania's joining of the European Union (EU) opened up the possibility to receive financial support from the EU Cohesion and Structural funds. Establishing a proper system for the management and control of EU financial support has become one of the most important tasks for the Lithuanian Government. Since non-eligible funds must be returned to the European Commission's account, the control system for EU financial support requires special attention. Since Lithuania entered the European Union, EU financial support has been included in the national budget. Since the budget of the Republic of Lithuania is subject to public financial control, EU financial support must come under public scrutiny as well. A control system for EU financial support was created during the 2004–2006 programming period. However, when defining the activities of the control subjects, insufficient powers were provided to ensure their effective work in the supervision of European Union funds.
Lithuania's joining of the European Union (EU) opened up the possibility to receive financial support from the EU Cohesion and Structural funds. Establishing a proper system for the management and control of EU financial support has become one of the most important tasks for the Lithuanian Government. Since non-eligible funds must be returned to the European Commission's account, the control system for EU financial support requires special attention. Since Lithuania entered the European Union, EU financial support has been included in the national budget. Since the budget of the Republic of Lithuania is subject to public financial control, EU financial support must come under public scrutiny as well. A control system for EU financial support was created during the 2004–2006 programming period. However, when defining the activities of the control subjects, insufficient powers were provided to ensure their effective work in the supervision of European Union funds. ; Lietuvai įstojus į Europos Sąjungą bei gaunant paramą iš Europos Sąjungos Sanglaudos ir struktūrinių fondų ypač svarbiu uždaviniu tapo veiksmingos Europos Sąjungos finansinės paramos kontrolės sistemos, kuri sudarytų sąlygas užtikrinti Bendrijos finansinių interesų saugumą Lietuvoje, sukūrimas. Viešųjų finansų srityje kontrolę vykdo visos valstybinės institucijos. Viešųjų finansų kontrolės objektas yra valstybės (savivaldybės) biudžetas, jo formavimo ir naudojimo sritys. Europos Sąjungos finansinė parama buvo įtraukta į Lietuvos Respublikos biudžeto specialiąsias programas. Lietuvos Respublikos biudžetas yra viešųjų finansų kontrolės objektas, todėl Europos Sąjungos finansinės paramos kontrolė yra viena iš viešųjų finansų kontrolės rūšių. Europos Sąjungos finansinės paramos kontrolė – kontrolės sistema, susidedanti iš atskirų elementų, veikiančių tarpusavyje, kurie padeda ją išskirti kaip vieną iš specifinių viešųjų finansų kontrolės rūšių. Europos Sąjungos finansinės paramos kontrolės ypatumus suponuoja Europos Sąjungos lėšų valdymo sistema bei kontrolės funkcijas vykdančios institucijos. Išskirtiniai jos bruožai 2004–2006 m. programavimo laikotarpiu yra vidaus audito tarnybų atliekami valdymo ir kontrolės sistemos vidaus auditai bei atrankiniai patikrinimai, kurie turi apimti ne mažiau nei 5 procentus visų struktūrinių ir 15 procentų visų Sanglaudos fondo tinkamų išlaidų bei remtis atrankine patvirtintų veiklos rūšių visuma. Lietuvos Respublikoje buvo sukurta Europos Sąjungos finansinės paramos kontrolės sistema 2004–2006 m. programavimo laikotarpiui, tačiau reglamentuojant kontrolės subjektų veiklą nebuvo suteikta pakankamai įgaliojimų, reikalingų užtikrinti sklandų jų darbą kontroliuojant Europos Sąjungos lėšų panaudojimą, t. y. vidaus audito padaliniai buvo pavaldūs tarpinių institucijų vadovams, todėl sunkiai buvo užtikrinamas jų nepriklausomumas. Taip pat nebuvo parengta teisinė bazė, sukurianti galimybes vidaus audito padaliniams atlikti patikrinimus ne ministerijų kompetencijai pavaldžiuose ar valdymo sričiai priskirtuose viešuosiuose juridiniuose asmenyse bei privačiuose juridiniuose asmenyse, nors parama tokiems juridiniams asmenims buvo skiriama, taip pat nei Europos Sąjungos Sanglaudos ir struktūrinių fondų auditą, nei kontrolės funkcijas atliekančioms įstaigoms teisės aktais nebuvo suteikta teisė iš rangovų ir subrangovų gauti visą auditui atlikti reikalingą medžiagą.
