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Colombia is a geographically diverse country mainly due to the Andean terrain, which creates a river system that combines different orders of drainages, physiography and water types, located in four areas: Caribbean, Pacific, Orinoco and Amazon. Hydrographic areas or basins are classified based on the watershed and have been treated regionally only in terms of political division to manage watersheds sections. A regional classification of freshwater ecosystems that combines both geographical and biological criteria, does not exist for Colombia, so the territorial planning and decision-makers do not consider aquatic ecosystems as a unit in their management guidelines. Therefore, the objective of this research was to propose continental hydro-biological units based on hydro-geographic and biological criteria, regrouping official hydrographic areas according to their fish species composition and the interpretation of their drainage network and geomorphological characteristics. There are 28 ecoregions proposed: six for the Caribbean region, eight for the Andean, five for the Pacific and nine for cis-Andean (five for Orinoco and four for Amazonas). These ecoregions can be used as a tool of territorial planning. ; Colombia es un país geográficamente heterogéneo debido principalmente a la orografía andina, la cual propicia una red hidrográfica que combina diferentes órdenes de drenajes, fisiografías y tipos de agua, ubicados en cuatro vertientes: Caribe, Pacífico, Orinoquia y Amazonia. Las zonas hidrográficas o cuencas están clasificadas con base en la divisoria de aguas y han sido tratadas de forma regional solamente en términos de división política para manejar las cuencas por secciones. Una clasificación regional de los ecosistemas dulceacuícolas que conjugue tanto este criterio geográfico como uno biológico, no existe para Colombia, por lo que la planeación territorial y los tomadores de decisiones no contemplan los ecosistemas acuáticos como una unidad en sus pautas de manejo. Por ello, el objetivo de esta investigación fue proponer unidades hidrobiológicas continentales con un criterio hidrogeográfico y biológico, para lo cual se reagruparon las zonas hidrográficas oficiales de acuerdo a la composición íctica, la interpretación de la red de drenaje y las características geomorfológicas de las cuencas. Se proponen 28 ecorregiones: seis para la región Caribe, ocho para la Andina, cinco para la Pacífica y nueve cisandinas (cuatro Amazonas y cinco Orinoco). Estas ecorregiones pueden usarse como una herramienta de planificación territorial.