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National audience ; Meeting the issues related to sustainable development of livestock farming requires innovations in genetics. In every sector, this is all about improving the robustness of animals by enhancing their abilities to adapt by including numerous efficiency traits in the breeding goals of selection programs particularly regarding health and adaptability to less standardized feed resources and of fluctuating nutritional value, changing and varied environments, and climate change. This leads to consider genotype-by-environment interactions within genetic evaluation procedures and to assess the performances of animals in low input systems, especially regarding feed and drug use. Since the end of the 2000s, the method that has been progressively used in all livestock breeding sectors is genomic selection, which, by disconnecting the computation of genetic values of selection candidates from phenotype recordings, makes it easier to select new traits and to take into account genotype-by-environment interactions. In the relatively near future, it will be technically possible to use strategies of targeted modification and selection of genomes that could substantially increase genetic gains, in comparison with those obtained with current genomic selection programs. However, the use of these new breeding techniques raises numerous issues on scientific, operational, ethical, and political levels. ; Les objectifs et méthodes d'amélioration génétique doivent évoluer pour répondre aux enjeux du développement durable des filières d'élevage. Dans toutes les espèces, il s'agit désormais d'améliorer la robustesse des animaux en promouvant leurs capacités d'adaptation, en intégrant dans les objectifs des programmes de sélection de nombreux caractères d'efficience, en particulier de santé et d'adaptation à des ressources alimentaires moins standardisées et de qualité fluctuante, à des environnements changeants et variés, et au changement climatique. Cela amène à considérer les interactions génotype x environnement dans ...

Les objectifs et méthodes d'amélioration génétique doivent évoluer pour répondre aux enjeux du développement durable des filières d'élevage. Dans toutes les espèces, il s'agit désormais d'améliorer la robustesse des animaux en promouvant leurs capacités d'adaptation, en intégrant dans les objectifs des programmes de sélection de nombreux caractères d'efficience, en particulier de santé et d'adaptation à des ressources alimentaires moins standardisées et de qualité fluctuante, à des environnements changeants et variés, et au changement climatique. Cela amène à considérer les interactions génotype x environnement dans la prédiction des valeurs génétiques et à évaluer les performances des animaux dans des systèmes à moindres intrants, notamment alimentaires et médicamenteux. Depuis la fin des années 2000, la méthode mise en oeuvre progressivement dans toutes les filières est la sélection génomique qui, en déconnectant le calcul des valeurs génétiques des candidats à la sélection de l'obtention de phénotypes, facilite la sélection de nouveaux caractères et la prise en compte des interactions génotype x environnement. Dans un futur relativement proche, il sera techniquement possible de mettre en oeuvre des stratégies de modification et sélection ciblées des génomes qui pourraient substantiellement accroitre les gains de progrès génétique en comparaison avec ceux obtenus dans les programmes actuels de sélection génomique. Toutefois, l'utilisation de ces nouvelles techniques de sélection animale pose de nombreuses questions, tant sur le plan scientifique, qu'opérationnel, éthique ou politique. ; Meeting the issues related to sustainable development of livestock farming requires innovations in genetics. In every sector, this is all about improving the robustness of animals by enhancing their abilities to adapt by including numerous efficiency traits in the breeding goals of selection programs particularly regarding health and adaptability to less standardized feed resources and of fluctuating nutritional value, changing and varied environments, and climate change. This leads to consider genotype-by-environment interactions within genetic evaluation procedures and to assess the performances of animals in low input systems, especially regarding feed and drug use. Since the end of the 2000s, the method that has been progressively used in all livestock breeding sectors is genomic selection, which, by disconnecting the computation of genetic values of selection candidates from phenotype recordings, makes it easier to select new traits and to take into account genotype-by-environment interactions. In the relatively near future, it will be technically possible to use strategies of targeted modification and selection of genomes that could substantially increase genetic gains, in comparison with those obtained with current genomic selection programs. However, the use of these new breeding techniques raises numerous issues on scientific, operational, ethical, and political levels.

National audience ; Meeting the issues related to sustainable development of livestock farming requires innovations in genetics. In every sector, this is all about improving the robustness of animals by enhancing their abilities to adapt by including numerous efficiency traits in the breeding goals of selection programs particularly regarding health and adaptability to less standardized feed resources and of fluctuating nutritional value, changing and varied environments, and climate change. This leads to consider genotype-by-environment interactions within genetic evaluation procedures and to assess the performances of animals in low input systems, especially regarding feed and drug use. Since the end of the 2000s, the method that has been progressively used in all livestock breeding sectors is genomic selection, which, by disconnecting the computation of genetic values of selection candidates from phenotype recordings, makes it easier to select new traits and to take into account genotype-by-environment interactions. In the relatively near future, it will be technically possible to use strategies of targeted modification and selection of genomes that could substantially increase genetic gains, in comparison with those obtained with current genomic selection programs. However, the use of these new breeding techniques raises numerous issues on scientific, operational, ethical, and political levels. ; Les objectifs et méthodes d'amélioration génétique doivent évoluer pour répondre aux enjeux du développement durable des filières d'élevage. Dans toutes les espèces, il s'agit désormais d'améliorer la robustesse des animaux en promouvant leurs capacités d'adaptation, en intégrant dans les objectifs des programmes de sélection de nombreux caractères d'efficience, en particulier de santé et d'adaptation à des ressources alimentaires moins standardisées et de qualité fluctuante, à des environnements changeants et variés, et au changement climatique. Cela amène à considérer les interactions génotype x environnement dans ...

National audience ; Meeting the issues related to sustainable development of livestock farming requires innovations in genetics. In every sector, this is all about improving the robustness of animals by enhancing their abilities to adapt by including numerous efficiency traits in the breeding goals of selection programs particularly regarding health and adaptability to less standardized feed resources and of fluctuating nutritional value, changing and varied environments, and climate change. This leads to consider genotype-by-environment interactions within genetic evaluation procedures and to assess the performances of animals in low input systems, especially regarding feed and drug use. Since the end of the 2000s, the method that has been progressively used in all livestock breeding sectors is genomic selection, which, by disconnecting the computation of genetic values of selection candidates from phenotype recordings, makes it easier to select new traits and to take into account genotype-by-environment interactions. In the relatively near future, it will be technically possible to use strategies of targeted modification and selection of genomes that could substantially increase genetic gains, in comparison with those obtained with current genomic selection programs. However, the use of these new breeding techniques raises numerous issues on scientific, operational, ethical, and political levels. ; Les objectifs et méthodes d'amélioration génétique doivent évoluer pour répondre aux enjeux du développement durable des filières d'élevage. Dans toutes les espèces, il s'agit désormais d'améliorer la robustesse des animaux en promouvant leurs capacités d'adaptation, en intégrant dans les objectifs des programmes de sélection de nombreux caractères d'efficience, en particulier de santé et d'adaptation à des ressources alimentaires moins standardisées et de qualité fluctuante, à des environnements changeants et variés, et au changement climatique. Cela amène à considérer les interactions génotype x environnement dans ...

National audience ; Meeting the issues related to sustainable development of livestock farming requires innovations in genetics. In every sector, this is all about improving the robustness of animals by enhancing their abilities to adapt by including numerous efficiency traits in the breeding goals of selection programs particularly regarding health and adaptability to less standardized feed resources and of fluctuating nutritional value, changing and varied environments, and climate change. This leads to consider genotype-by-environment interactions within genetic evaluation procedures and to assess the performances of animals in low input systems, especially regarding feed and drug use. Since the end of the 2000s, the method that has been progressively used in all livestock breeding sectors is genomic selection, which, by disconnecting the computation of genetic values of selection candidates from phenotype recordings, makes it easier to select new traits and to take into account genotype-by-environment interactions. In the relatively near future, it will be technically possible to use strategies of targeted modification and selection of genomes that could substantially increase genetic gains, in comparison with those obtained with current genomic selection programs. However, the use of these new breeding techniques raises numerous issues on scientific, operational, ethical, and political levels. ; Les objectifs et méthodes d'amélioration génétique doivent évoluer pour répondre aux enjeux du développement durable des filières d'élevage. Dans toutes les espèces, il s'agit désormais d'améliorer la robustesse des animaux en promouvant leurs capacités d'adaptation, en intégrant dans les objectifs des programmes de sélection de nombreux caractères d'efficience, en particulier de santé et d'adaptation à des ressources alimentaires moins standardisées et de qualité fluctuante, à des environnements changeants et variés, et au changement climatique. Cela amène à considérer les interactions génotype x environnement dans ...

A sequential selection scheme, where candidates are ranked using a multiple trait BLUP selection index, was modelled deterministically. This model accounts for overlapping generations and for the reduction of genetic variances under selection, in order to predict the asymptotic genetic gain. Sires and dams are selected among the pairs already created whose progeny have maximum expected average genetic merit. This procedure allows for an optimal use of the available information when the pairs are selected. Effects of selection on the mean and variance of the traits measured on selected animals are accounted for using the Tallis formulae, while a matrix formula is used in order to simultaneously derive genetic lags and gains. The evolution of inbreeding rate was not modelled. Numerical applications were related to a turkey breeding plan. The impact of the relative weight given to growth (male and female body weight, measured at 12 and 16 weeks) and reproduction traits (three partial egg number records) on the expected genetic gains was investigated. Influence of demographic parameters was also studied. Different selection strategies were compared. When the selection objective is mainly to improve laying ability, it is more relevant to increase the amount of information on laying performance, and to apply selection of best mated pairs, rather than to reduce generation intervals by only using the youngest sires. This modelling can be viewed as a useful tool, in order to foresee the consequences of any change in the breeding plan for the long-term genetic gain. ; Un schéma de sélection, séquentiel, où les animaux sont classés à l'aide d'un indice BLUP multicaractère a été modélisé. Les générations sont chevauchantes, et la réduction des variances génétiques sous l'effet de la sélection est pris en compte, afin de prédire le progrès génétique asymptotique. Les reproducteurs choisis sont ceux dont la descendance a, en espérance, la plus forte valeur génétique additive (sélection des meilleurs couples parmi tous ceux déjà formés). Cette procédure permet l'utilisation optimale de l'information recueillie au moment du choix des reproducteurs. Les effets de la sélection sur la moyenne et la variance des caractères sont pris en compte par les formules de Tallis, tandis qu'une formule matricielle est utilisée afin de calculer simultanément le progrès génétique et les écarts de niveau entre cohortes. Les applications numériques portent sur un schéma « dinde» et étudient l'influence de la pondération relative donnée au poids et à la ponte dans l'objectif de sélection sur le progrès génétique attendu pour les sept caractères inclus dans l'objectif (poids mâles et femelles mesurés à 12 et 16 semaines, et trois pontes partielles), et des paramètres démographiques du schéma. Différentes stratégies de sélection sont ainsi comparées. Quand les caractères de ponte sont prépondérants dans l'objectif de sélection, il est préférable d'augmenter le nombre de femelles mesurées en ponte, et de pratiquer une sélection des couples, plutôt que de chercher à réduire l'intervalle de génération en n'utilisant que les plus jeunes mâles. Cette modélisation constitue, malgré l'absence de prise en compte de la consanguinité, un outil utile pour le sélectionneur, afin de prévoir les conséquences, à long terme, de sa politique de sélection.